通常來說，醫藥冷庫安裝在室內，否則陽光雨水等會造成冷庫保溫庫板變形而影響隔熱保溫性能，從而影響庫內醫藥產品器械的質量安全保證。同理，在醫藥冷庫安裝位置選擇上要避免庫體周圍有熱能或發熱的物體存在，以免削弱制冷效果和增加運行能耗。建議醫藥冷庫安裝要選擇在平地、通風、陰涼的位置。
在庫體保溫板材料及規格上，聚氨酯雙面彩鋼板是常規選擇。密度越高且厚度越厚的保溫板具有更好的隔熱保溫性能，從而更好地維持庫內溫度無波動和降低冷庫能耗，當然價格也越高。
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